种犬在自然交配时，母犬的交配时间应依其发情的具体情况而定，不能简单地按发情时间来推算(因有些母犬发情几天后才被发现)。具体方法是观察母犬阴部流出的血液变成淡红色且略带粘性，阴户肿胀光亮，其基部变得松软，此时即可交配，时间约在发情的第9-13天左右，老龄犬稍早些，青年犬稍晚些，这是发情排卵鉴定的一种临床观察方法,也可使用动物B超机检查其卵泡发育情况来确定发情。对部分外生殖观察有困难的犬还可采取实验室检查法(如阴道上皮细胞镜检法及血中孕酮测定法等)及用腹腔镜观察子宫卵巢变化检查法、动物B超机超声检查方法、试情法等方法来确定最佳配种时间。
    母犬发情是不分时间季节的，常年都有，这就要求我们繁育员及技术人员在种犬管理上要认真负责，对每头母犬应进行细致的观察，最好要进行动物B超机检查。但是，母犬发情是具有一定的规律性，即有一个发情周期，这个周期平均时间为180天左右，这有利于繁育员掌握母犬发情时间，即可依据上一次发情的时间来推算下一次发情的大概时间,如果想准确的判断可以通过动物B超机检查卵泡来进行。繁育员加强了对犬的观察，预测其发情日期，技术人员对发情母犬认真检查，观察掌握发情征兆和进展，或使用动物B超机检查卵泡判断发情状况，根据配种计划及该犬以往配种情况适时采取合适的配种方法进行配种。对那些自由交配有困难的犬进行人工辅助。